يطمح قطاع الدراسات العليا والبحث العلمي بالجامعة إلى تحقيق التميز الأكاديمي والبحثي في مجالات بحثية مختلفة وفق الخطة الاستراتيجية للجامعة ورؤيتها الرامية إلى تحقيق التميز والريادة، ووفقًا لرؤية مصر 2030. كما يسعى القطاع إلى الإسهام مع الكليات وأقسامها الأكاديمية في استحداث برامج دراسات عليا تحقق التميز البحثي والنوعي والأكاديمي بالجامعة، كما ييسر التعاون مع المؤسسات البحثية من جهة أخرى للاستفادة من إمكاناتها البشرية والمادية، وكذا تشجيع المشروعات البحثية التي يقوم عليها فريق بحثي جاد ومؤهل من منتسبي الجامعة.
ولغايات إتاحة الفرص لأعضاء هيئة التدريس ومعاونيهم والباحثين في الجامعة للتفاعل مع الباحثين العاملين في المؤسسات الأكاديمية أو البحثية المحلية والإقليمية، والتعرف على ما يستجد من طرق البحث وموضوعاته، فإن الجامعة تدعم مشاركاتهم في المؤتمرات المتخصصة داخل وخارج مصر، وحث الباحثين فيها على الحضور والمشاركة البناءة. ولدعم الوضع التنافسي للجامعة أنشأت وحدة منوطة بالتَّصنيف تسعى جاهدة لوضع الجامعة في مصافّ الجامعات العالمية المميزة وبما تصدره من توجيهات وأسس وحوافز تقرها الجامعة لتحقيق ذلك الهدف.
وتحفيزاً للبحث العلمي وتقديراً لدور أعضاء هيئة التدريس ومعاونيهم وتشجيعاً للباحثين والمبتكرين تقدم جامعة الوادي الجديد عدد من الجوائز والمكافآت للمتميزين من أبنائها الباحثين مما سينعكس بشكل إيجابي على إنجازات الجامعة في المجال البحثي ويضاعف عدد الأبحاث المنشورة في المجلات العلمية المتخصصة ذات التصنيف الدولي. حاملين في رحلتنا زاد الصدق وسلامة القصد آملين أن تضيف برامج الدراسات العليا لمجتمعنا ولمصرنا الحبيبة ما تستحقه من مكانة راقية تصنع لها غدًا مشرقًا.